Коллегия Межрегионального операционного Управления Федерального казначейства является постоянно действующим совещательным органом при руководителе и создается с целью коллегиальной выработки решений по актуальным вопросам деятельности Межрегионального операционного Управления Федерального казначейства.

Молодежный совет Межрегионального операционного Управления Федерального казначейства является постоянно действующим совещательным органом и создается с целью коллегиальной выработки решений по актуальным вопросам молодежной политики в Межрегиональном операционном Управлении Федерального казначейства.